Excelente central portugués, sus grandes características fuerón su anticipación y el juego aéreo. Internacional absoluto cón la selección portuguesa disputo tres Eurocopas cón la camiseta lusitana.
El equipo de su vida fué el Porto cón el que debutó en 198 y cón el que ganó tres títulos de liga, tres copas portuguesas y dos supercopas. En 1994 firmó por el A.C. Parma italiano cón el que ganó una copa de la Uefa y posteriormente en verano de 1996 fichó por el F.C. Barcelona a petitición expresa de Sir. Bobby Robson que había fichado ése verano por el club catalán y lo había tenido a sus órdenes en el club portugues unos años antes. Su primera temporada en Barcelona fué sensacional realizando una gran pareja de centrales junto a Abelardo y logrando la Recopa de Europa, la copa del rey y la supercopa española. Tras una temporada más en Barcelona ganando una supercopa de Europa, la liga española y la copa del rey, se marcha a la Lazio debido a una muy buena oferta y a la gran competéncia en Barcelona ya cón Van Gaal en el banquillo y el fichaje de Winston Bogarde que se une a la nómina de centrales cón Abelardo y Nadal. En su regreso a Itália, Fernando Couto sigue aumentando su admirable palmarés logrando el título de liga cón el conjunto romano, dos copas de Itália, dos supercopas italianas y una nueva Recopa de Europa
