Zé Roberto ha sido un interior izquierdo de exquisita técnica, cón gran capacidad para asociarse cón sus compañeros cón una buena llegada, buen goleador y gran asistente. Se dió a conocer en la Portuguesa de Brasil cón la que debutó en 1994 y en la que jugó tres temporadas. En verano de 1997 tras ser campeón de la copa América y de la copa confederaciones cón la verde amarelha fichó por el Real Madrid dónde ganó una supercopa de España aunque por la falta de minutos debido a la gran competéncia que tenía acabó volviendo a Brasil a la disciplina del Flamengo. Estubo unos meses en el club carioca y su gran nivel le valió el fichaje por el Bayer Leverkusen. En el que disputó cuatro magníficas temporadas que le valierón para ser un habitual en la canarinha cón la que ganó su segunda copa América en 1999 en la edición disputada en Venezuela.
Sus cuatro excelentes años en el Leverkusen le permitierón fichar por el gran club de Alemania, El Bayern Munich cón el que ha conquistado sus grandes éxitos a nivel de club proclamándose campeón de la bundesliga y de la copa Alemania en tres ocasiones cón tres dobletes las tempordas 2002-03, 2004-05, 2005-06, siendo campeón en 2005 también de la copa confederaciones. En verano de 2006, Zé Roberto ficha por el Santos de Brasil cón el que consigue el campeonato paulista en 2007. Pero el talentoso mediocampista zurdo volvería al Bayern Munich para jugar entre 2007 y 2009 ganando una copa alemana más en 2008, y en verano de 2009 fichaba por el Hamburgo.
